Väi­tös­kir­ja­tut­ki­ja, proteiini-​nukleiinihappohybridimateriaalit

Aalto-yliopistossa tiede ja taide kohtaavat tekniikan ja talouden. Rakennamme kestävää tulevaisuutta saavuttamalla läpimurtoja avainalueillamme ja niiden yhtymäkohdissa. Samalla innostamme tulevaisuuden muutoksentekijöitä ja luomme ratkaisuja maailman suuriin haasteisiin. Yliopistoyhteisöömme kuuluu 16 000 opiskelijaa, yli 400 professoria ja yli 5000 työntekijää. Kampuksemme sijaitsee Espoon Otaniemessä. Monimuotoisuus on osa meitä, ja teemme jatkuvaa työtä yhteisömme monimuotoisuuden ja syrjimättömyyden varmistamiseksi. Siksi kannustammekin päteviä hakijoita taustasta riippumatta liittymään yhteisöömme. Etsimme nyt Väitöskirjatutkijaa proteiini-nukleiinihappohybridimateriaalien alalle Haemme väitöskirjatutkijaa Suomen Akatemian rahoittamaan tutkimushankkeeseen ( https://research.fi/en/results/funding/88763 ), jossa kehitetään ohjelmoitavia proteiini-nukleiinihappohybridimateriaaleja RNA-kuljetukseen. RNA-pohjaiset hoitomuodot, kuten mRNA-rokotteet ja geeniterapiat, tarvitsevat kuljetusjärjestelmiä, jotka suojaavat nukleiinihappoja ja mahdollistavat niiden tehokkaan vapautumisen solujen sisällä. Tässä hankkeessa yhdistetään DNA-origaminanorakenteita ja viruskapsidiproteiineja, jotta voidaan tutkia, miten kapsidiproteiinien ominaisuudet vaikuttavat proteiinipäällysteisien nanorakenteiden muodostumiseen, stabiilisuuteen ja toimintaan. Hankkeen keskeisenä tavoitteena on muodostaa systemaattinen rakenne–toimintakaavio, joka yhdistää kapsidiproteiinien ominaisuudet, kuten rakenteellisen arkkitehtuurin, oligomerisaatiokäyttäytymisen ja varausjakauman, pinnoitteen morfologiaan, stabiilisuuteen sekä RNA:n kuljetustehokkuuteen. Tuloksena syntyvä viitekehys tarjoaa laajasti hyödynnettäviä suunnitteluperiaatteita proteiini-nukleiinihappohybridimateriaaleille sekä tulevaisuuden RNA-kuljetusteknologioille. Tutkimusympäristö Väitöskirjatutkija työskentelee hankkeen vastuullisen johtajan tohtori Donna McNeale ohjauksessa osana professori Mauri Kostiaisen johtamaa Biohybridimateriaalit-tutkimusryhmää. Aalto-yliopiston Kemian tekniikan korkeakoulussa sijaitseva Biotuotteiden ja biotekniikan laitos (BIO2) on kansainvälisesti tunnettu korkeatasoisesta tutkimuksestaan kehittyneiden materiaalien valmistamiseksi kestävästi uusiutuvista luonnonvaroista. Laitos kuuluu alallaan Euroopan johtavien tutkimuslaitosten ja yliopistojen joukkoon. BIO2-laitoksen tavoitteena on olla osaltaan synnyttämässä uusia resurssitehokkaita ja ympäristöystävällisiä valmistusmenetelmiä. Laitos keskittyy tutkimuksessaan erityisesti lignoselluloosapohjaisiin materiaaleihin ja tuotteisiin nanomateriaaleista uusiin selluloosapohjaisiin tekstiileihin. Biotieteiden alueella laitoksella on tutkimusta bioprosessitekniikassa, molekyylibiotekniikassa, entsyymiteknologiassa, metaboliamuokkauksessa, synteettisessä biologiassa sekä biomolekyyli- ja biohybridimateriaaleissa. Roolisi Väitöskirjatutkijana tutkit proteiinipinnoitettujen DNA-origaminanorakenteiden suunnittelua, kokoamista ja karakterisointia sekä niiden potentiaalia RNA:n kuljetusalustoina. Keskeisiin tehtäviisi kuuluvat: DNA-origami-nanorakenteiden suunnittelu ja valmistus Viruskapsidiproteiinien ja niihin liittyvien proteiinirakennuspalikoiden tuottaminen, puhdistaminen ja karakterisointi Proteiinipinnoitettujen DNA-nanorakenteiden rakenteellinen ja biofysikaalinen karakterisointi RNA:n kapseloinnin ja kuljetustehokkuuden arviointi Rakenteellisten, kineettisten ja toiminnallisten aineistojen analysointi Tutkimustulosten julkaiseminen tieteellisissä julkaisuissa sekä esittäminen kansainvälisissä konferensseissa Hanke on ensisijaisesti kokeellinen, mutta sen aikana tuotettavat aineistot tarjoavat vahvan perustan tuleville laskennallisille tutkimuksille. Hakijoita, jotka ovat kiinnostuneita biomolekyylien mallintamisesta ja simuloinnista, kannustetaan hakemaan tehtävää. Kokemuksesi ja tavoitteesi Etsimme hakijaa, jolla on vahva kiinnostus biomolekyylien itsejärjestäytymiseen, nanoteknologiaan ja nukleiinihappopohjaisiin hoitomuotoihin. Tausta yhdellä tai useammalla seuraavista osa-alueista katsotaan eduksi: Proteiinitekniikka, biofysiikka tai biomolekyylien itsejärjestäytyminen DNA-nanoteknologia ja DNA-origami Viruskapsidit tai viruksista inspiroituneet nanomateriaalit Rakenteelliset tai biofysikaaliset karakterisointimenetelmät RNA-terapiat ja nukleiinihappojen kuljetus Molekyylien väliset vuorovaikutukset ja supramolekulaarinen järjestäytyminen Biologisten ja nanoskaalan järjestelmien kvantitatiivinen analyysi Biomolekyylien mallintaminen ja simulointi, mukaan lukien molekyylidynamiikkasimulaatio ja korkeajakoinen simulaatio Tehtävän vaatimukset Valitulla kandidaatilla tulee olla Maisterintutkinto soveltuvalta alalta, esimerkiksi biotekniikasta, biofysiikasta, molekyylibiotieteistä, nanoteknologiasta, kemiasta, kemiantekniikasta tai muulta läheisesti liittyvältä alalta Hyvät englannin kielen kirjalliset ja suulliset viestintätaidot Kyky työskennellä sekä itsenäisesti että osana kansainvälistä tutkimus